定量PCR儀主要由兩部分組成分析，一個是PCR系統(tǒng)廣泛認同，一個是熒光檢測系統(tǒng)。選擇定量PCR儀的關鍵——由于定量PCR必需借助樣本和標準品之間的對比來實現(xiàn)定量的是目前主流，對于定量PCR系統(tǒng)來說高質量，重要的參數(shù)除了傳統(tǒng)PCR的溫控精確性各領域、升降溫速度等等戰略布局，更重要的還在于樣品孔之間的均一性，以避免微小的差別被指數(shù)級放大效率和安。
至于熒光檢測系統(tǒng)，多色多通道檢測是當今的主流趨勢——儀器的激發(fā)通道越多應用提升，儀器適用的熒光素種類越多不同需求，儀器適用范圍就越寬；多通道指可同時檢測一個樣品中的多種熒光新品技，儀器就可以同時檢測單管內多模版或者內標樣品，通道越多積極回應，儀器適用范圍越寬慢體驗、性能就更強大。熒光檢測系統(tǒng)主要包括激發(fā)光源和檢測器全會精神。激發(fā)光源有鹵鎢燈光源左右、氬離子激光器、發(fā)光二極管LED光源智能化，前者可配多色濾光鏡實現(xiàn)不同激發(fā)波長生產製造，而單色發(fā)光二極管LED價格低、能耗少綜合措施、壽命長多元化服務體系，不過因為是單色，需要不同的LED才能更好地實現(xiàn)不同激發(fā)波長攜手共進。監(jiān)測系統(tǒng)有超低溫CCD成像系統(tǒng)和PMT光電倍增管實力增強，前者可以一次對多點成像，后者靈敏度高但一次只能掃描一個樣品擴大公共數據，需要通過逐個掃描實現(xiàn)多樣品檢測，對于大量樣品來說需要較長的時間。
定量PCR儀需要考慮的另外一個因素是軟件設計設計標準，這一點目前較新型號的儀器都有不錯的配套軟件可以滿足常規(guī)使用深度。