熒光定量PCR儀是一種用于分子生物學(xué)檢測(cè)的高靈敏度勇探新路、高特異性的分析儀器集成應用。通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針,對(duì)PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記和跟蹤生產創效,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)反應(yīng)過(guò)程中的熒光信號(hào)變化方案。在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)將進一步,利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程競爭力。隨著反應(yīng)循環(huán)數(shù)的增加深入,目標(biāo)DNA的擴(kuò)增會(huì)導(dǎo)致熒光信號(hào)的增強(qiáng)。通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)的變化提升,可以繪制出熒光強(qiáng)度相對(duì)于循環(huán)數(shù)的擴(kuò)增曲線快速增長,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)靶DNA的定量分析。
熒光定量PCR儀的前期準(zhǔn)備工作:
1、樣品準(zhǔn)備
核酸提取:從樣本(如組織開放以來、細(xì)胞等形式、血液等)中提取DNA或RNA。提取過(guò)程中要嚴(yán)格按照相應(yīng)的核酸提取試劑盒說(shuō)明書操作組合運用,以確保核酸的純度和完整性的特點。例如,使用柱式提取法時(shí)研究與應用,要注意細(xì)胞裂解的充分性適應性、結(jié)合條件的控制以及洗脫液的用量和溫度等因素。
樣品鑒定與定量:對(duì)提取的核酸進(jìn)行質(zhì)量和濃度檢測(cè)有效保障〖ぐl創作?梢允褂梅止夤舛扔?jì)測(cè)定核酸的濃度,通過(guò)A260/A280比值來(lái)判斷核酸的純度(純DNA或RNA的A260/A280比值一般在1.8-2.0之間)稍有不慎。同時(shí)探索,利用瓊脂糖凝膠電泳等方法來(lái)鑒定核酸的完整性,確保沒(méi)有明顯的降解全面協議。
稀釋樣品:根據(jù)熒光定量PCR的檢測(cè)范圍和樣品中目標(biāo)核酸的濃度重要作用,將樣品稀釋到合適的濃度。如果樣品濃度過(guò)高講實踐,可能會(huì)導(dǎo)致PCR反應(yīng)過(guò)早進(jìn)入平臺(tái)期增幅最大,影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性;如果樣品濃度過(guò)低最為顯著,則可能無(wú)法檢測(cè)到足夠的信號(hào)滿意度。
2奮戰不懈、引物和探針設(shè)計(jì)
引物設(shè)計(jì):根據(jù)目標(biāo)基因的序列信息,設(shè)計(jì)特異性的引物的過程中。引物的長(zhǎng)度一般在18-25個(gè)堿基對(duì)之間物聯與互聯,GC含量在40%-60%之間。引物的3'端應(yīng)避免連續(xù)的G或C範圍和領域,且不能有互補(bǔ)序列勇探新路,以防止引物二聚體的形成⌒问??梢允褂脤I(yè)的引物設(shè)計(jì)軟件(如Primer3擴大、OligoPerfect等)來(lái)進(jìn)行設(shè)計(jì),并通過(guò)BLAST等工具驗(yàn)證引物的特異性傳遞。
探針設(shè)計(jì)(對(duì)于使用探針?lè)ǖ那闆r):熒光探針的設(shè)計(jì)要考慮其與目標(biāo)序列的特異性結(jié)合和熒光標(biāo)記的穩(wěn)定性讓人糾結。探針的長(zhǎng)度通常在15-30個(gè)堿基之間,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)的選擇要根據(jù)儀器的檢測(cè)通道來(lái)確定發揮效力。例如全面革新,常見(jiàn)的熒光基團(tuán)有FAM(用于檢測(cè)綠色熒光)、VIC(用于檢測(cè)黃色熒光)等穩定發展,淬滅基團(tuán)有TAMRA方便、BHQ等。
3更好、試劑準(zhǔn)備
PCR反應(yīng)混合液:按照試劑盒說(shuō)明書配制PCR反應(yīng)混合液基石之一。一般包括緩沖液、dNTPs(三磷酸脫氧核苷)安全鏈、引物行業分類、探針(如果使用)、Taq DNA聚合酶(或其他合適的DNA聚合酶)等增持能力。在配制過(guò)程中應用領域,要注意各種試劑的比例和添加順序,確毙盐?;旌暇鶆蜻M行部署。
模板添加:將稀釋后的樣品(DNA或RNA)加入到PCR反應(yīng)混合液中。加入的體積要根據(jù)PCR反應(yīng)體系的總體積和樣品濃度來(lái)確定新模式,通常每管反應(yīng)體系中加入1-5μL的樣品重要作用。