實(shí)時(shí)熒光定量PCR所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種：熒光探針和熒光染料。現(xiàn)將其原理簡述如下：

　　1.TaqMan熒光探針：PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針溝通機製，該探針為一寡核苷酸還不大，兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)規定。探針完整時(shí)規模設備，報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收；PCR擴(kuò)增時(shí)凝聚力量，Taq酶的5'－3'外切酶活性將探針酶切降解開展試點，使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離，從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號事關全面，即每擴(kuò)增一條DNA鏈交流等，就有一個(gè)熒光分子形成製造業，實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步發展目標奮鬥。而新型TaqMan-MGB探針使該技術(shù)既可進(jìn)行基因定量分析，又可分析基因突變（SNP）狀態，有望成為基因診斷和個(gè)體化用藥分析的技術(shù)平臺規劃。

　　2.SYBR熒光染料：在PCR反應(yīng)體系中，加入過量SYBR熒光染料更多的合作機會，SYBR熒光染料非特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后項目，發(fā)射熒光信號，而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號重要方式，從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加*同步綜合運用。SYBR僅與雙鏈DNA進(jìn)行結(jié)合，因此可以通過溶解曲線增產，確定PCR反應(yīng)是否特異脫穎而出。

　　3. 分子信標(biāo)：是一種在5和3末端自身形成一個(gè)8個(gè)堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記寡核苷酸探針，兩端的核酸序列互補(bǔ)配對的方法，導(dǎo)致熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)緊緊靠近積極影響，不會產(chǎn)生熒光。PCR產(chǎn)物生成后生產創效，退火過程中進一步提升，分子信標(biāo)中間部分與特定DNA序列配對，熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光。